La "Premier League" 1999 si disputa con girone unico a 10 squadre e doppio turno andata-ritorno, ma nel corso della stagione avvengono diversi fatti degni di rilievo e testimoni della precarietà della regolarità nel campionato armeno.   Il Karabakh Stepanakert infatti viene espulso dalla Federazione dopo 15 giornate a causa di problemi finanziari, con annullamento di tutti i risultati conseguiti.    La stagione sportiva sarebbe entusiasmante, con la lotta serrata tra Shirak Gyumri, Ararat Yerevan e Tsement Ararat che si conclude a vantaggio dei primi per un solo punto di vantaggio sull'Ararat e due sullo Tsement ma dopo polemiche roventi.   Alla penultima giornata, infatti, lo Shirak, al quale sarebbe bastato un pareggio per laurearsi campione, viene battuto dallo Tsement Ararat con un rigore concesso al 100' : a seguito del reclamo dello Shirak la Federazione ordina la ripetizione dell'incontro per palese e grave irregolarità arbitrale, mentre nel frattempo l'Ararat, vincendo all'ultima giornata, ha raggiunto lo Shirak in vetta alla classifica.   Lo 0-0 nella ripetizione dell'incontro Tsement-Shirak assegna giustamente il titolo allo Shirak Gyumri.    In coda, dopo la stagione regolare, lasciano la massima serie il Dvin Artashat, ritiratosi alla 30^ giornata, e lo FK Gyumri, mentre il Kilikia Yerevan retrocede dopo spareggio con il Mika Ashtarak ma sarà poi ripescato all'inizio della stagione successiva a causa di altri ritiri.                   

Risultati

NOTE :
CAMBI DI NOME : Lo Erebuni-Homenmen Yerevan diventa Erebuni Yerevan - Lo Shirak-2 Gyumri diventa FK Gyumri - Il Pyunik Yerevan diventa Kilikia Yerevan
RITIRI : Il Karabakh Stepanakert è stato espulso dalla Federazione dopo 15 giornate per problemi finanziari : tutti i suoi incontri sono stati annullati e sono riportati tra parentesi
Il Dvin Artashat si è ritirato dopo la ventinovesima giornata : tutti i suoi incontri successivi sono stati assegnati con il 3-0 a favore della squadra avversaria.
(1) - L'Ararat Yerevan gioca le partite casalinghe ad Abovyan
(2) - Lo Zvartnots Yerevan gioca le partite casalinghe ad Ashtarak
(3) - L'incontro Dvin - Zvartnots viene assegnato 0-3 dalla Federazione
(4) - L'incontro FK Yerevan - Erebuni viene assegnato 3-0 dalla Federazione per rinuncia dell'Erebuni, che ha perso il proprio sponsor
(5) - L'incontro Erebuni - Dvin viene assegnato 3-0 dalla Federazione perchè il Dvin ha schierato un giocatore in posizione irregolare
(6) - L'incontro Shirak - FK Gyumri, terminato 15-5 con 8 reti di Yepranosyan e 6 di Bernetsyan, è stato annullato dalla Federazione e trasformato in 3-0
(7) - Il Dvin ha giocato l'incontro Shirak - Dvin cono solo 9 giocatori
(8) - Dopo la 29^ giornata il Dvin Artashat si è ritirato dal campionato e tutti gli incontri successivi sono stati assegnati 3-0 alla squadra avversaria
(9) - L'incontro Ararat - FK Yerevan è stato assegnato 3-0 dalla Federazione dopo che lo FK Yerevan si era ritirato all'86', sul 3-1, per protesta contro la terza espulsione decretata dall'arbitro
(10) - L'incontro Tsement - Shirak è stato ripetuto il 13.12 in quanto la Federazione ha cancellato l'incontro del 4.12, terminato 1-0 per lo Tsement con grave irregolarità arbitrale (gol su rigore al 100').  Con la sconfitta lo Shirak sarebbe stato raggiunto all'ultima giornata dall'Ararat Yerevan.

Classifica finale 

Spareggio Promozione/Retrocessione

Mika Ashtarak - Kilikia Yerevan    1 - 0   (Armavir, 12/12/1999)
Reti: Armen Sahakyan 51'

Mika Ashtarak - Promosso in Prima Divisione
Kilikia Yerevan - Retrocesso in Seconda Divisione, poi ripescato 

Campionato 1998  -  Campionato 2000